比希在《達爾文的黑匣子》中提出了一個觀念——不可約化的複雜性。也就是說生命在分子水準上是一個不可分解的複雜系統，只要抽掉一環，整體就會崩潰。而達爾文的進化論立足于漸變，進化其實就是累加微小變化的結果。
　　
比希本人是正牌生物化學家，這個發現是完全的科學發現，他給達爾文出的難題在於：生命在某個範疇內，它必須一步到位，不是任何變化都是累積的結果。那麼這一步到位是怎麼產生的呢？這時自然選擇說就很無力了。
　　
反駁比希的其實是兩類人，一類人說比希是神創論，比希在政治上不正確，這種說法其實是誅心之論，完全可以忽略。另一類人反駁比希所舉的鞭毛系統還可以繼續分解，但他們無法證明可以無限分解下去，這樣即使比希的鞭毛還可以分解，那分解的結果同樣也是一個不可約化的複雜系統，所以這類人只反駁了比希的例子，沒有觸及到比希的核心思想。
　　
方舟子是一個堅定的達爾文進化論捍衛者，但他在最近的一篇文章《科學大爭論——生命能否自發產生？》寫了一段接近比希的生命複雜不可約化的話：今天的生物學家已無人相信自發發生說，是因為從來沒有實驗能夠真正證明它的確存在，而且微生物培養實驗已無數次地證明，只有把微生物接種到滅菌的培養基上才能長出微生物。況且，微生物其實有著非常複雜的結構，難以想像它們能夠從非生命物質自發產生。
　　
雖然方舟子接下來又補了一句，邏輯上生命一定是從非生命自發產生的，這其實是他的無神論信仰了，跟科學無關。
　　
進化論其實解釋的是生命起源後的事，並不涉及生命起源，迄今這跟宇宙起源一樣，還是一個謎。這是進化論一創立就明瞭的問題，而這個問題本身就蘊含著進化論致命的缺陷——存在微小變化無法跨越的鴻溝。
　　
生命起源之謎就在於無法解釋從無機物到生命的跨越，而比希的“不可約化的複雜性”不過是進一步論證了生命起源後也有微小變化無法跨越的鴻溝。
　　
從哲學角度來看，站在達爾文和比希後面的其實一個是還原論，一個是整體論。這一對冤家跟哲學上所有基本矛盾一樣，是誰也搞不定誰的。還原論在拉普拉斯那裏達到頂峰，他的著名的拉普拉斯妖理論是這麼說的，只要能確定從最大天體到最輕原子的運動的現時狀態，就能按照力學規律推算出整個宇宙的過去狀態和未來狀態。
　　
這其實也是一種還原論，還原論是說把物質的高級運動形式(如生命運動)歸結為低級運動形式(如機械運動)、用低級運動形式的規律代替高級運動形式的規律的形而上學方法。還原論認為，各種現象都可被還原成一組基本的要素，各基本要素彼此獨立，不因外在因素而改變其本質。通過對這些基本要素的研究，可推知整體現象的性質。
　　
眾所周知，後來的量子力學在微觀層面上否定了還原論，量子論認為，我們的世界是一個非機械的、相互聯繫的、不可分割(還原)的世界。物質世界的根本元素不是機械的可以分割的原子、質子、中子，而是一個有機聯繫的整體。
　　
相比拉普拉斯在在物理上的還原論，進化論可以說是在生命上的還原論，而比希的不可約化的複雜性，其實是指出了在生命系統中也存在著不可分解的量子態。
　　
所以說，比希在進化論上挑起的爭論其實涉及到了人類的基本觀念，就跟歷史上的光是微粒還是波的爭論一樣，無論哪一方曾經占到壓倒優勢，甚至一方銷聲匿跡幾百年，最後還是不斷的反復拉鋸，直至把科學送入到一個新的領域。
　　
那些動輒就說比希是神創論、偽科學的人，其實是在損害真正的科學探索精神。

PS：前不久知道了比希和他的智設論，很欣賞他的洞見，但我反對把智設論作為一種科學理論來教授，因為科學理論一定要可知，用不可知來回答問題那只能是信仰，而不是解釋。就好比我不知道無機物是怎麼進化成生命的，但我肯定生命是由無機物進化而來的，這就是一個典型的信仰，而不是解釋。愛因斯坦相信上帝不擲骰子，這也是信仰，不是解釋。

另外，無論是設計還是進化，都是上帝的創造，就好比人類事先在電腦上設計一個程式，讓它自我演化，難道說只有初始狀態才是人類的創造，演化過程就不是人類的創造嗎？

我認為比希最大的價值就在於用科學觀察的手段，證明了在生命誕生過程中，不都是累加的結果，不是所有量變都能質變，有些時候必須一步到位。除了不可約化的複雜，中性突變也是屬於這種情況，在中性突變中，不是適者生存，而是幸者生存，因為它跟自然選擇沒啥關係，誰也不知道這個突變是在什麼情況下發生的，只能歸功於幸運了。但幸運也是不可知的，歸功於幸運，與歸功於神，對於科學而言，沒有本質區別。

當然比希提出的幾個例子是不是真的不可約化，也有待商榷，但可以肯定的是，在生命誕生過程中，一定存在不可約化的複雜系統。反觀人類的創造，也可以發現這樣的規律：設定——演化——設定——演化……每一次設定其實都是一個不可約化的複雜，雖然演化能無限複雜下去，但初始設定的簡單卻不能演化出來。

光靠無限累加是不能構成大千世界的，物理上的還原論失敗了，生命上的還原論同樣如此。否則，如果無限累加能做成任何事，那無限累加就是神了，一旦我們遇到無法解釋的現象，就說這是無限累加的結果，這跟一切歸於神有啥區別？無論什麼信仰，把其用於解釋，都是思想的懶惰，科學進步的阻礙。